Il 19 aprile 1541 il voto unanime dei compagni elegge Ignazio di Loyola primo preposito della Compagnia di Gesù. Una volta avviate le opere di carattere religioso e sociale egli si dedica alla fondazione del Collegio romano e del Collegio germanico. Col primo apre le scuole gratuite di grammatica, umanità e dottrina cristiana aperte a tutti. Col secondo prepara un gruppo di sacerdoti di origine germanica, esperti nella lingua del paese, i quali, una volta formati a Roma, possano tornare in patria a combattere contro i protestanti.